Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms