Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms