Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rom1P32958 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms