Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms