Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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