Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms