Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms