Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CftrP26361 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CftrP26361 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CftrP26361 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CftrP26361 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CftrP26361 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CftrP26361 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms