Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms