Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a1P24549 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms