Protein–RNA interactions for Protein: P24288

Bcat1, Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcat1P24288 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcat1P24288 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms