Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata3P23772 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms