Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsta3P23591 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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