Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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