Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RarbP22605 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RarbP22605 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms