Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Edn1P22387 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms