Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms