Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TP20293 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TP20293 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TP20293 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TP20293 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TP20293 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TP20293 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TP20293 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TP20293 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TP20293 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TP20293 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TP20293 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TP20293 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TP20293 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TP20293 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TP20293 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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