Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P20040 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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