Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a1P19437 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms