Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms