Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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