Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Hoxb1P17919 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Hoxb1P17919 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxb1P17919 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxb1P17919 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxb1P17919 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxb1P17919 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxb1P17919 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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