Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs1P17533 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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