Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms