Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrphP15331 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrphP15331 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrphP15331 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrphP15331 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrphP15331 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrphP15331 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrphP15331 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrphP15331 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms