Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms