Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms