Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms