Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms