Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms