Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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DmdP11531 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DmdP11531 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DmdP11531 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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DmdP11531 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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DmdP11531 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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DmdP11531 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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DmdP11531 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DmdP11531 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms