Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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