Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms