Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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