Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdgfrbP05622 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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