Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04214 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04214 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04214 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04214 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04214 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04214 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04214 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04214 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04214 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04214 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P04214 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04214 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P04214 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P04214 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P04214 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P04214 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P04214 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms