Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamc1P02468 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms