Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01641 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01641 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01641 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01641 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01641 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms