Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms