Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BlmO88700 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BlmO88700 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BlmO88700 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BlmO88700 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BlmO88700 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BlmO88700 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BlmO88700 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BlmO88700 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BlmO88700 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BlmO88700 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BlmO88700 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BlmO88700 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BlmO88700 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BlmO88700 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BlmO88700 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BlmO88700 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BlmO88700 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BlmO88700 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms