Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pak1O88643 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1O88643 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1O88643 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms