Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd46O88174 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd46O88174 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd46O88174 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd46O88174 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd46O88174 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd46O88174 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd46O88174 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd46O88174 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd46O88174 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms