Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms