Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lnx1O70263 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms