Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f6O54917 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms