Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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