Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CrxO54751 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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CrxO54751 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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CrxO54751 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CrxO54751 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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