Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cavin1O54724 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms