Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms